摘要: 引言大量实验表明,针对同一靶基因的不同si RNA序列具有不同的沉默效率,为了能够运用RNAi技术更有效地沉默靶基因,需要在RNAi的第一步,也是其成功与否的关键环节?si RNA序列的设计方面进行更多的改进。本文将在以下几个方面探讨si RNA序列设计方面的最新研究进展,作为应用RNAi技术时的参考。1SiRNA序列的设计RNAi最终要通过si RNA片段与靶基因结合并使之降解,因此,确保高度同源于靶基因而绝无与其他基因同源的si RNA序列,是决定RNAi特异性的关键所在,也是si RNA设计的基本原则。从具有不同沉默效率的si RNA序列中筛选出高效的si R-NA序列,需要经过严密的设计和不断的实验检验1。1.1si RNA序列在靶基因中的位置从靶基因起始密码子AUG下游50~100个核苷酸开始搜寻理想的si RNA序列,越靠近靶基因的3′端,其基因沉默效果可能越好2。以前的研究表明:不要以5′非翻译区(5′UTR)和3′非翻译区(3′UTR)及起始密码子附近序列作为设计si RNA的模板,这些区域含有调节蛋白结合位点(如翻译起始复合物),调节蛋白可与RISC竞争结合si RNA序列,降低R...