高级搜索

铁死亡相关基因GLS2在泛癌中的预后及免疫价值

潘月眉, 孙之, 赵倩倩, 胡雪雪, 王传玺

潘月眉, 孙之, 赵倩倩, 胡雪雪, 王传玺. 铁死亡相关基因GLS2在泛癌中的预后及免疫价值[J]. 肿瘤防治研究, 2024, 51(3): 169-177. DOI: 10.3971/j.issn.1000-8578.2024.23.0986
引用本文: 潘月眉, 孙之, 赵倩倩, 胡雪雪, 王传玺. 铁死亡相关基因GLS2在泛癌中的预后及免疫价值[J]. 肿瘤防治研究, 2024, 51(3): 169-177. DOI: 10.3971/j.issn.1000-8578.2024.23.0986
PAN Yuemei, SUN Zhi, ZHAO Qianqian, HU Xuexue, WANG Chuanxi. Role of Ferroptosis-related Gene GLS2 in Pan-cancer Prognosis and Immunity[J]. Cancer Research on Prevention and Treatment, 2024, 51(3): 169-177. DOI: 10.3971/j.issn.1000-8578.2024.23.0986
Citation: PAN Yuemei, SUN Zhi, ZHAO Qianqian, HU Xuexue, WANG Chuanxi. Role of Ferroptosis-related Gene GLS2 in Pan-cancer Prognosis and Immunity[J]. Cancer Research on Prevention and Treatment, 2024, 51(3): 169-177. DOI: 10.3971/j.issn.1000-8578.2024.23.0986

铁死亡相关基因GLS2在泛癌中的预后及免疫价值

基金项目: 国家自然科学基金面上项目(82172672);山东省自然科学基金(ZR2021MH379)
详细信息
    作者简介:

    潘月眉(1998-),女,硕士在读,主要从事肺癌放疗抵抗及免疫治疗研究,ORCID: 0009-0008-8843-0713

    通信作者:

    王传玺(1977-),男,博士,主任医师,主要从事肺癌放疗抵抗及免疫治疗研究,E-mail: chuanxiwang@126.com,ORCID: 0000-0003-4356-3623

  • 中图分类号: R730

Role of Ferroptosis-related Gene GLS2 in Pan-cancer Prognosis and Immunity

Funding: Natural Science Foundation of China (No. 82172672); Natural Science Foundation of Shandong Province (No. ZR2021MH379)
More Information
  • 摘要:
    目的 

    基于生物信息学方法评估铁死亡相关基因GLS2在泛癌中对预后及免疫的相关作用。

    方法 

    采用癌症基因组图谱(TCGA)、GTEx、癌症细胞系百科全书(CCLE)及国际癌症基因组联盟(ICGC)等在线数据库进行GLS2基因泛癌分析,从基因表达、基因突变、生存分析、免疫浸润、免疫检查点相关基因和TMB及MSI等多个方面挖掘GLS2基因在不同肿瘤中的作用。

    结果 

    GLS2在大多数癌组织与癌旁组织的表达具有显著差异,并且该表达与这些癌症的预后相关。在多种癌症中,GLS2的表达与免疫细胞浸润之间存在正相关关系,并与免疫检查点相关基因有关。GLS2还与TMB、MSI和甲基化呈正相关,其表达与可能的治疗反应具有一定关系。

    结论 

    通过对铁死亡相关基因GLS2的泛癌分析表明,GLS2的表达可能作为肾透明细胞癌、肾上腺皮质癌、肺腺癌、胰腺癌诊断及预后的重要标志物。

     

    Abstract:
    Objective 

    To assess the role of the ferroptosis-associated gene GLS2 in the prognosis of pan-cancer and immunity using bioinformatics methods.

    Methods 

    GLS2 expression levels in pan-cancer were profiled using publicly available databases: The Cancer Genome Atlas, GTEx, Cancer Cell Line Encyclopedia and the International Cancer Genome Consortium. The aim was to explore the role of GLS2 gene expression, gene variation survival analysis, immune infiltration, immune checkpoint related genes, TMB, and MSI in different tumors.

    Results 

    Difference in GLS2 expression levels between cancer and paraneoplastic tissues was statistically significant in most cancer types, and the expression level was correlated with survival in these cancer types. A positive correlation was found between GLS2 expression and immune cell infiltration in multiple cancer types, and GLS2 expression level was positively correlated with TMB, MSI, and methylation, and its expression is an indicator for potential therapeutic response.

    Conclusion 

    Pan-cancer analysis shows that the ferroptosis-related gene GLS2 can be used as a diagnostic and prognostic marker of clear cell carcinoma of kidney, adrenocortical carcinoma, lung adenocarcinoma, and pancreatic cancer.

     

  • 胃癌是常见的消化道恶性肿瘤,约占胃全部恶性肿瘤的95%,进展快,预后差,严重影响患者身心健康和生活质量,其发病率呈逐年上升趋势[1-2]。胃癌根治术联合D2淋巴结清扫术是当前外科治疗局部进展期胃癌的标准术式之一[3-5]。随着手术技术的日益完善,以及新型手术器械广泛应用,胃癌根治术后的并发症显著下降,但术后短期并发症严重影响患者住院时间、出血风险和生活质量,因此术后出现的短期并发症仍是备受关注的问题[6-8]。目前对于术后短期并发症影响患者远期生存率的分析报道较少。本研究旨在探讨胃癌D2根治术后短期并发症对患者远期生存率的影响,并分析相关影响因素。

    收集2010年1月—2011年12月于福建医科大学附属第一医院接受胃癌D2根治手术治疗的421例胃癌患者。纳入标准:(1)所有患者经临床表现、影像学资料及病理首次确诊为胃癌(Ⅰa~Ⅲc期),未进行术前相关治疗;(3)临床资料和生存数据完整,Clavien-Dindo(CD)评分系统进行并发症分级评估(CD评分≥Ⅱ级);(3)所有患者均接受胃癌D2根治术。排除标准:(1)患者合并其他恶性肿瘤;(2)有精神障碍、意识障碍;(3)合并严重肝肾功能和心肺功能障碍; (4)肿瘤复发或者转移;(5)失访的患者及意外事件引起的死亡。按照术后短期有无并发症分为:实验组(并发症组)76例,其中男58例,女18例,年龄45~75岁;对照组(无并发症组)345例,其中男256例,女89例,年龄45~89岁。倾向性得分匹配法(propensity score matching, PSM)平衡各变量,剔除未匹配的患者后,144例胃癌术后患者纳入本研究,其中76例为实验组,68例为对照组。本研究符合医学伦理学要求,患者及家属对本次研究知情并签署知情同意书。

    421例患者行根治性全胃切除或者根治性远端胃切除。根据第13版日本胃癌规约,所有患者按照标准的D2手术范围清除区域淋巴结。根治性远端胃切除患者清除淋巴结范围为第1、3、4、5、6、7、8、9、11、12a组淋巴结,根治性全胃清除的淋巴结范围为第1、2、3、4、5、6、7、8a、9、10、11、12a组淋巴结。根治性远端胃癌患者的消化道重建方式为布朗吻合;根治性全胃患者的消化道重建方式为Roux-en-Y吻合,所有吻合口均以丝线加固,残端包埋,术毕创面彻底止血,大量温热蒸馏水冲洗腹腔,放置引流管,逐层关腹。

    (1) 纳入分析的因素有年龄、性别、肿瘤最大径、pTNM分期、淋巴结转移、组织分化、脉管癌栓、神经侵犯和淋巴管侵犯等;(2)采用CD评分系统进行并发症分级评估观察患者术后短期并发症情况,包括肺部感染、腹腔感染、切口感染、吻合口出血、吻合口瘘、吻合口狭窄、胃排空延迟、肠梗阻和多器官衰竭等;(3)两组患者随访5年的生存情况。

    采用门诊随访、信件回访及电话问询等方式进行随访。随访截至2016年3月2日。患者的生存时间(月数)为自手术日期起至死亡日期或随访截止日期。对于失访和意外事故死亡的患者予以剔除。

    采用SPSS24.0版统计软件处理数据。PSM通过软件中PS最邻近匹配法获得,其中最近距离与倾向得分对数的标准偏差的卡尺距离为0.02。实验组和对照组的基线资料比较采用卡方检验,生存分析采用Kaplan-Meier法,协变量与预后之间的关联分析采用Log rank单因素分析和Cox多因素分析。P < 0.05为差异有统计学意义。

    PSM前共纳入的421例患者中术后短期并发症(76例)有肺部感染、腹腔感染、切口感染、吻合口出血、吻合口瘘、吻合口狭窄、胃排空延迟、肠梗阻和多器官衰竭等。76例(18.05%)术后出现短期并发症为实验组、345例(81.95%)未出现明显并发症为对照组。两组患者基线参数比较结果显示,仅术后住院时间差异有统计学意义(P < 0.001)。为进一步减小选择性偏倚,本研究对421例患者通过PSM按照1:1匹配,均衡所有基线特征,最终144例纳入本研究,其中实验组76例,对照组68例,见表 1

    表  1  基于PSM前后患者的临床病理特征
    Table  1  Clinicopathological characteristics of patients before and after PSM
    下载: 导出CSV 
    | 显示表格

    PSM前,实验组相对于对照组的远期生存率(HR=1.324, 95%CI: 0.942~1.860, p=0.106)差异无统计学意义。PSM后,与对照组比较,术后短期并发症患者的远期生存率(HR=1.175, 95%CI: 0.746~1.850, p=0.486)差异仍无统计学意义,结果进一步表明胃癌术后短期并发症对远期生存率影响结果无统计学意义,见图 1

    图  1  PSM前(A)后(B)患者术后短期并发症的生存曲线
    Figure  1  Survival curves of gastric cancer patients with short-term postoperative complications before(A) and after (B) PSM

    PSM后亚组分析结果显示,肺部感染(HR=1.087, 95%CI: 0.679~1.741, p=0.728)、切口感染(HR=1.234, 95%CI: 0.679~2.244, p=0.490)、腹腔感染(HR=0.846, 95%CI: 0.421~1.697, p=0.637)和其他并发症(吻合口出血、吻合口瘘、吻合口狭窄、胃排空延迟、肠梗阻和多器官衰竭等)(HR=1.009, 95%CI: 0.503~2.204, p=0.980)的胃癌患者的远期生存率均无统计学意义(均P > 0.05),见图 2。进一步表明胃癌D2根治术后短期并发症对患者远期生存时间无明显影响。

    图  2  PSM后患者术后短期并发症亚组的生存曲线
    Figure  2  Survival curves of gastric cancer patients in subgroups of short-term postoperative complications after PSM
    A: pulmonary infection; B: incision infection; C: abdominal infection; D: other complications (anastomotic bleeding, anastomotic leakage, anastomotic stenosis, delayed gastric emptying, intestinal obstruction and multiple organ failure, etc.)

    PSM后,采用Log rank单因素分析144例患者远期生存率的影响因素,其中肿瘤的最大径、组织学类型、pTNM分期、分化程度、淋巴结转移率、脉管内癌栓、神经侵犯和淋巴管侵犯与胃癌术后的远期生存率显著相关(均P < 0.05)。将上述有统计学意义的参数进行Cox多因素分析,结果表明,仅组织学类型、淋巴结转移率和pTNM分期是患者远期生存率的独立预后影响因素,见表 2~3

    表  2  PSM后影响患者预后的单因素分析
    Table  2  Univariate analysis of prognostic factors of gastric cancer patients after PSM
    下载: 导出CSV 
    | 显示表格
    表  3  PSM后影响预后的Cox多因素分析
    Table  3  Cox multivariate analysis of prognostic factors of gastric cancer patients after PSM
    下载: 导出CSV 
    | 显示表格

    在我国各种恶性肿瘤中发病率占第二位,死亡率居第三位[9]。目前,胃癌根治术联合D2淋巴结清扫术是当前外科治疗局部进展期胃癌的标准术式之一。在不影响胃癌根治疗效的前提下,减少术后短期并发症的发生,成为国内外胃恶性肿瘤治疗关注的热点问题[10],术后短期并发症加剧疾病痛苦,延缓患者术后恢复,延长住院天数,增加医疗资源负担及患者家庭的经济负担,因此控制和降低术后短期并发症的发生率具有重要临床意义。现对于术后短期并发症对于患者远期生存时间的影响研究尚有争议。

    本研究中患者术后短期并发症主要以肺部感染为首,其发生率情况与既往研究胃癌术后远期生存率[11]的结果符合。

    PSM前,对421例患者进行生存分析,结果显示胃癌D2根治术后的短期并发症未能对患者的远期生存率产生明显的影响。为减少选择偏倚,进行PSM平衡各变量。PSM后的结果表明,术后短期并发症仍未对患者的远期生存时间产生明显的影响,但根据Kaplan-Meier生存曲线描绘得到,无术后短期并发症的患者生存时间优于术后短期并发症患者[12],可能与术后短期并发症引起的炎性反应有关,并影响后续的首次化疗效果,表明控制和降低胃癌术后短期并发症仍具有一定的临床意义。我们分别对主要并发症包括肺部感染、切口感染、腹腔感染和其他症状(吻合口出血、吻合口瘘、吻合口狭窄、胃排空延迟、肠梗阻和多器官衰竭等)进行远期生存率分析,结果显示差异均无统计学意义(均P > 0.05),进一步表明术后短期并发症均对患者术后远期生存时间无显著影响。

    探讨胃癌D2根治术后对患者远期生存时间的影响因素,对PSM后纳入的144例患者进行Log rank单因素分析患者远期生存率的影响因素,结果显示肿瘤的最大径、组织学类型、pTNM分期、分化程度、淋巴结转移率、脉管内癌栓、神经侵犯和淋巴管侵犯与胃癌术后的远期生存率显著相关[13]。Cox多因素分析结果表明,组织学类型、淋巴结转移率和pTNM分期是患者远期生存率的独立预后影响因素。有研究表明对于胃癌患者术后进行组织学类型、淋巴结转移率和pTNM分期的诊断具有良好指示预后的指标[14]

    胃癌患者临床症状较为隐匿,通常就诊时已属中晚期,失去了最佳治疗时机[15];早期胃癌的5年生存率可达95%,而进展期胃癌的生存率低于20%[16],因此提高胃癌的早期诊断率对胃癌的早期治疗至关重要。要根本上提高患者术后的远期生存率,通过早发现、早诊断和早治疗,将癌症尽量控制在早期,减低胃癌的晚期发生率。

    本研究采用生存情况预测模型,结合有效检验,得到单个预测因子,并通过多因素校正等评价了该预测模型,有效地将临床各个病理特征及其所占的权重体现出来,具有较高、较强的预测水平,探讨对临床上行胃癌D2根治术后短期并发症对远期生存时间的影响,并提供精确的评估和预后判断的依据,为将来提高患者远期生存率提供新的改善方法与思路。

    综上所述,胃癌D2根治术后的短期并发症对患者远期生存率没有显著性影响,但仍会降低患者术后的生活质量,加剧医疗资源压力,积极预防并控制并发症具有一定的临床意义。

    Competing interests: The authors declare that they have no competing interests.
    利益冲突声明:
    所有作者均声明不存在利益冲突。
    作者贡献:
    潘月眉:研究设计、选题、数据分析及论文撰写
    孙之、赵倩倩、胡雪雪:文献检索及整理
    王传玺:论文指导及修改
  • 图  1   不同组织和肿瘤中GLS2的mRNA表达水平

    Figure  1   mRNA expression levels of GLS2 in different tissue and tumors

    图  2   TCGA数据库中GLS2和OS在多种肿瘤中mRNA表达水平的相关性

    Figure  2   Association between mRNA expression levels of GLS2 and OS in multiple tumors from TCGA database

    图  4   TCGA数据库中GSL2 mRNA表达水平与多发肿瘤DSS的相关性

    Figure  4   Association between GLS2 mRNA expression levels and DSS in multiple tumors from the TCGA database

    图  5   TCGA数据库中高、低GLS2 mRNA表达组的DSS分析

    Figure  5   DSS difference between high and low GLS2 mRNA expression groups from the TCGA database

    图  6   通过TCGA数据库中的TIMER计算GLS2 mRNA表达水平与六种常见类型免疫细胞浸润分数之间的相关性

    Figure  6   Correlation between GLS2 mRNA expression level and infiltration scores of six common-type immune cells, calculated by TIMER from TCGA database

    图  7   来自TCGA数据库的多个肿瘤中GLS2 mRNA表达水平与免疫检查点mRNA表达之间的相关性

    Figure  7   Correlation between GLS2 mRNA expression levels and immune checkpoints’ mRNA expression in multiple tumors from the TCGA database

    图  8   TCGA数据库中不同肿瘤中TMB(A)、MSI(B)和GLS2 mRNA表达水平之间的关系

    Figure  8   Relation between TMB(A), MSI(B), and GLS2 mRNA expression levels in various tumors in the TCGA database

    图  9   TCGA数据库预测GLS2 mRNA表达与五个重要MMR基因突变水平之间的相关性

    Figure  9   Correlation between GLS2 mRNA expression and mutation levels of five significant MMR genes in the TCGA database

  • [1]

    Dixon SJ, Lemberg KM, Lamprecht MR, et al. Ferroptosis: an iron-dependent form of nonapoptotic cell death[J]. Cell, 2012, 149(5): 1060-1072. doi: 10.1016/j.cell.2012.03.042

    [2]

    Chen X, Kang R, Kroemer G, et al. Broadening horizons: the role of ferroptosis in cancer[J]. Nat Rev Clin Oncol, 2021, 18(5): 280-296. doi: 10.1038/s41571-020-00462-0

    [3]

    Yang WS, Kim KJ, Gaschler MM, et al. Peroxidation of polyunsaturated fatty acids by lipoxygenases drives ferroptosis[J]. Proc Natl Acad Sci U S A, 2016, 113(34): E4966-E4975.

    [4]

    Santana-Codina N, Mancias JD. The Role of NCOA4-Mediated Ferritinophagy in Health and Disease[J]. Pharmaceuticals (Basel), 2018, 11(4): 114. doi: 10.3390/ph11040114

    [5]

    Lei G, Zhang Y, Koppula P, et al. The role of ferroptosis in ionizing radiation-induced cell death and tumor suppression[J]. Cell Res, 2020, 30(2): 146-162. doi: 10.1038/s41422-019-0263-3

    [6]

    Lei G, Mao C, Yan Y, et al. Ferroptosis, radiotherapy, and combination therapeutic strategies[J]. Protein Cell, 2021, 12(11): 836-857. doi: 10.1007/s13238-021-00841-y

    [7]

    Ye LF, Chaudhary KR, Zandkarimi F, et al. Radiation-Induced Lipid Peroxidation Triggers Ferroptosis and Synergizes with Ferroptosis Inducers[J]. ACS Chem Biol, 2020, 15(2): 469-484. doi: 10.1021/acschembio.9b00939

    [8]

    Lei G, Zhuang L, Gan B. Targeting ferroptosis as a vulnerability in cancer[J]. Nat Rev Cancer, 2022, 22(7): 381-396

    [9]

    Masisi BK, El Ansari R, Alfarsi L, et al. The role of glutaminase in cancer[J]. Histopathology, 2020, 76(4): 498-508. doi: 10.1111/his.14014

    [10]

    Ferreira IM, Quesñay JEN, Bastos AC, et al. Structure and activation mechanism of the human liver-type glutaminase GLS2[J]. Biochimie, 2021, 185: 96-104. doi: 10.1016/j.biochi.2021.03.009

    [11]

    Dias MM, Adamoski D, Dos Reis LM, et al. GLS2 is protumorigenic in breast cancers[J]. Oncogene, 2020, 39(3): 690-702. doi: 10.1038/s41388-019-1007-z

    [12]

    Szeliga M, Bogacińska-Karaś M, Kuźmicz K, et al. Downregulation of GLS2 in glioblastoma cells is related to DNA hypermethylation but not to the p53 status[J]. Mol Carcinog, 2016, 55(9): 1309-1316. doi: 10.1002/mc.22372

    [13]

    Liu H, Kiseleva AA, Golemis EA. Ciliary signalling in cancer[J]. Nat Rev Cancer, 2018, 18(8): 511-524. doi: 10.1038/s41568-018-0023-6

    [14]

    Hensley CT, Wasti AT, DeBerardinis RJ. Glutamine and cancer: cell biology, physiology, and clinical opportunities[J]. J Clin Invest, 2013, 123(9): 3678-3684. doi: 10.1172/JCI69600

    [15]

    Triplett TA, Garrison KC, Marshall N, et al. Reversal of indoleamine 2, 3-dioxygenase-mediated cancer immune suppression by systemic kynurenine depletion with a therapeutic enzyme[J]. Nat Biotechnol, 2018, 36(8): 758-764. doi: 10.1038/nbt.4180

    [16] 张尊, 孙圣荣. CD73调控肥胖相关乳腺癌肿瘤免疫微环境[J]. 武汉大学学报(医学版), 2022, 43(5): 748-754. [Zhang Z, Sun S R. CD73 regulates tumor immune microenvironment in obesity-related breast cancer[J]. Wuhan Da Xue Xue Bao(Yi Xue Ban), 2022, 43(5): 748-754.]

    Zhang Z, Sun S R. CD73 regulates tumor immune microenvironment in obesity-related breast cancer[J]. Wuhan Da Xue Xue Bao(Yi Xue Ban), 2022, 43(5): 748-754.

    [17]

    Qian L, Wang F, Lu SM, et al. A Comprehensive Prognostic and Immune Analysis of Ferroptosis-Related Genes Identifies SLC7A11 as a Novel Prognostic Biomarker in Lung Adenocarcinoma[J]. J Immunol Res, 2022, 2022: 1951620.

    [18]

    Zou J, Du K, Li S, et al. Glutamine Metabolism Regulators Associated with Cancer Development and the Tumor Microenvironment: A Pan-Cancer Multi-Omics Analysis[J]. Genes (Basel), 2021, 12(9): 1305. doi: 10.3390/genes12091305

    [19]

    Vega DM, Yee LM, McShane LM, et al. Aligning tumor mutational burden (TMB) quantification across diagnostic platforms: phase Ⅱ of the Friends of Cancer Research TMB Harmonization Project[J]. Ann Oncol, 2021, 32(12): 1626-1636. doi: 10.1016/j.annonc.2021.09.016

    [20]

    Sung MT, Wang YH, Li CF. Open the Technical Black Box of Tumor Mutational Burden (TMB): Factors Affecting Harmonization and Standardization of Panel-Based TMB[J]. Int J Mol Sci, 2022, 23(9): 5097. doi: 10.3390/ijms23095097

    [21]

    Joshi SS, Badgwell BD. Current treatment and recent progress in gastric cancer[J]. CA Cancer J Clin, 2021, 71(3): 264-279. doi: 10.3322/caac.21657

    [22]

    Germano G, Amirouchene-Angelozzi N, Rospo G, et al. The Clinical Impact of the Genomic Landscape of Mismatch Repair-Deficient Cancers[J]. Cancer Discov, 2018, 8(12): 1518-1528. doi: 10.1158/2159-8290.CD-18-0150

    [23]

    Greenberg MVC, Bourc'his D. The diverse roles of DNA methylation in mammalian development and disease[J]. Nat Rev Mol Cell Biol, 2019, 20(10): 590-607. doi: 10.1038/s41580-019-0159-6

    [24]

    Chan TA, Yarchoan M, Jaffee E, et al. Development of tumor mutation burden as an immunotherapy biomarker: utility for the oncology clinic[J]. Ann Oncol, 2019, 30(1): 44-56. doi: 10.1093/annonc/mdy495

    [25]

    Fridman WH, Miller I, Sautès-Fridman C, et al. Therapeutic Targeting of the Colorectal Tumor Stroma[J]. Gastroenterology, 2020, 158(2): 303-321. doi: 10.1053/j.gastro.2019.09.045

图(9)
计量
  • 文章访问数:  2111
  • HTML全文浏览量:  1270
  • PDF下载量:  964
  • 被引次数: 0
出版历程
  • 收稿日期:  2023-09-12
  • 修回日期:  2023-12-09
  • 网络出版日期:  2024-08-08
  • 刊出日期:  2024-03-24

目录

/

返回文章
返回
x 关闭 永久关闭