肿瘤防治研究  2015, Vol. 42 Issue (4): 403-406
本刊由国家卫生和计划生育委员会主管,湖北省卫生厅、中国抗癌协会、湖北省肿瘤医院主办。
0

文章信息

王静, 徐金升, 白亚玲, 张胜雷. 2015
WANG Jing, XU Jinsheng, BAI Yaling, ZHANG Shenglei. 2015
赖氨酸甲基转移酶SET8结构和功能及其与肿瘤关系的研究进展
Association of Structure and Functions of Lysine Methyltransferase SET8 with Tumorigenesis
肿瘤防治研究, 2015, 42(04): 403-406
Cancer Research on Prevention and Treatment, 2015, 42(04): 403-406
http://www.zlfzyj.com/CN/10.3971/j.issn.1000-8578.2015.04.019

文章历史

收稿日期:2014-03-11
修回日期:2014-08-22
赖氨酸甲基转移酶SET8结构和功能及其与肿瘤关系的研究进展
王静, 徐金升, 白亚玲, 张胜雷    
050011 石家庄, 河北医科大学第四医院肾内科
摘要:SET8(又称SETD8、PR-SET7、KMT5a)是现今发现唯一能够特异性单甲基化H4K20的赖 氨酸甲基转移酶。SET8及其催化形成的H4K20me1共同参与了细胞周期调控、染色质结构及基因转 录的调节。近年来研究发现SET8在多种肿瘤组织中高表达,参与调控体内细胞的细胞周期、增殖及 凋亡等过程,涉及肿瘤的发生、生长、转移等多个环节,有望成为肿瘤治疗的新靶点。本文主要从 SET8的结构、功能及其在肿瘤发生中的作用等方面综述了SET8的研究进展。
关键词赖氨酸甲基转移酶     SET8     肿瘤    
Association of Structure and Functions of Lysine Methyltransferase SET8 with Tumorigenesis
WANG Jing, XU Jinsheng, BAI Yaling, ZHANG Shenglei    
Department of Nephrology, The Fourth Hospital of Hebei Medical University, Shijiazhuang 050011, China
Abstract:SET8, also named SETD8, PR-SET7 or KMT5a, is a sole lysine methyltransferase that catalyzes monomethylation of histone H4 lysine 20(H4K20). SET8 and the H4K20me1 catalyzed by SET8 are jointly implicated in modulating cell cycle, maintaining chromatin structure and regulating the transcription of several genes. Recently, it is reported that the high expression of SET8 involves in regulating cell cycle, cell proliferation and apoptosis. SET8 is also related with tumorigenesis, progression and metastasis, suggesting that SET8 may be a potential target for cancer treatment. In this review, we focus on analyzing the association of the structure and function of SET8 and its effect in tumorigenesis.
Key words: Lysine methyltransferase     SET8     Tumor    
0 引言

SET8又称SETD8、PR-SET7、KMT5a,2002 年从HeLa细胞中提纯并克隆,是现今发现唯一能 够特异性单甲基化组蛋白H4赖氨酸20位(histone H4 lysine20,H4K20)的赖氨酸甲基转移酶[1, 2], 存在于有丝分裂细胞染色体中[3]。SET8表达于整 个细胞周期中,具有调节细胞周期、维持基因组 完整性以及调控基因表达的作用。目前研究显示 SET8与人类肿瘤关系密切,参与调控了体内细胞 的细胞周期、细胞增殖及凋亡等过程,涉及到肿 瘤的发生、生长、转移等多个环节,现将相关研 究进展综述如下。 1 SET8的基因定位、分子结构

SET8蛋白编码基因位于染色体12q24.31,人 类SET8基因可表达SET8a和SET8b两种蛋白,其中 SET8a长度为1 059 bp,含352个氨基酸[3]。SET8b长 度为969 bp,含322个氨基酸,较SET8a少第10~40 位氨基酸。在人体内,SET8主要是以b型存在,并 以同型二聚体的形式发挥作用[4]。SET8蛋白质序列 从C端至N端依次包含高度保守的SET结构域、PIP 结构域、细胞周期蛋白激酶磷酸化共有序列,在空 间结构上形成C-侧翼、SETI、核心SET结构域和N- 侧翼[5]。SET8中高度保守的SET结构域中酪氨酸残 基Tyr 334、Tyr245与单甲基化的赖氨酸产物形成的 氢键决定了SET8单甲基化活性[1]。位于SET结构域 上游的PIP结构域与增殖细胞核抗原(proliferating cell nuclear antigen,PCNA)结合通过诱导CRL4Cdt2 (Cullin4 E3 泛素连接酶复合物)将SET8泛素化并 降解,维持SET8在细胞内含量的平衡,PIP结构域 中的Thr182、Asp183、Arg188和Arg189 是CRL4Cdt2介导泛素化降解的关键位点[4]。在SET8 N端还存在 一个低同源性的非保守区域,是由约50个氨基酸组 成的细胞周期蛋白激酶磷酸化共有序列和一个可被 APC/CCdh1泛素E3复合物识别的破坏框(destruction box,D-box)组成,在调节SET8的表达方面也起 着重要作用[6]2 SET8的生物学功能

在细胞内SET8 调控组蛋白修饰和细胞周 期、调节染色质结构和基因转录,其催化形成的 H4K20me1在染色体固缩、DNA复制及细胞周期检 验点激活中发挥重要调控作用。 2.1 SET8调控组蛋白修饰

组蛋白是染色质中的主要蛋白质,在调控基 因表达方面起着重要作用。组蛋白合成过程中的 主要修饰方式有乙酰化、磷酸化、甲基化等, 其中甲基化仅发现于H3的9和27位、H4的20位的 赖氨酸。组蛋白H4位于DNA与核小体的交界处, H4K20me1修饰可以影响染色体的高级结构,促进 细胞间期中染色体的固缩[7],而SET8是现今发现 唯一能够特异性单甲基化H4K20的赖氨酸甲基转 移酶,这为SET8调控H4K20而发挥调节基因表达 的生理作用奠定了理论基础。 2.2 SET8调控细胞周期

研究发现,在哺乳动物细胞周期调控中SET8 发挥着重要作用,SET8缺乏可导致细胞周期障 碍,表现为染色体固缩障碍、G2期阻滞[8]。SET8 主要通过翻译后的泛素化和磷酸化来严格调控其 在细胞周期中的含量,在G1和M期SET8含量较 低,在G2和有丝分裂期SET8含量较高[9, 10]。在G1/S 过渡期,泛素E3连接酶SCF(skp2)能够直接降 解储存库中游离的SET8[11];在S期,SET8主要经 PCNA依赖性的CRL4(Cdk2) 途径泛素化降解, 其余游离的SET8 通过SCF(skp2)途径被降解; 在G2期,CRL4(Cdk2)与SCF(skp2)复合体活 性下降,SET8 含量逐渐上升;在M期,Cdk1/cyclinB 复合体磷酸化SET8的S29位点,抑制APC/C (Cdh1)介导的泛素化降解;至有丝分裂中期 时,SET8被Cdc14磷酸酶去磷酸化,进而被APC/C (Cdh1)降解。APC/C(Cdh1)降解活性维持至 G1期结束。此外,SET8还能通过调节有关基因表 达影响DNA复制[4]2.3 SET8调节染色质结构

在哺乳动物胚胎干细胞和果蝇细胞中,SET8缺 乏将导致染色体固缩障碍以及DNA复制缺陷[7, 12]。 SET8及高水平H4K20me1如何影响染色质结构的机 制尚不明确。一方面,Davey等对核小体结构研究 发现H4K20能够与邻近核小体H2A发生联系直接 影响染色质高级结构[13, 14]。另一方面,H4K20me1 能够结合染色质固缩相关蛋白。体外实验发现, H4K20me1结合蛋白L3MBTL1能够通过两个相邻核 小体甲基化的赖氨酸间相互作用从而诱发局部染色 质固缩[15]。此外,在体外果蝇(Drosophila)染色质 聚集实验中,L3MBTL1与H4K20me1 结合可招募特 定的组蛋白去乙酰化酶,使组蛋白发生去乙酰化从 而调控染色质结构[16]2.4 SET8调节基因表达

SET8通过调控H4K20的甲基化状态来调控相关 基因的表达,其机制可能是H4K20me1直接促进染色 质固缩抑制转录[7, 17],或H4K20me1被进一步甲基化为 H4K20me2/3间接抑制基因转录。SET8调控Wnt靶基 因表达并参与Wnt3a介导的胚胎发育[18]。SET8还参 与 Twist 调控上皮间质的转化[19]。SET8可特异性 单甲基化p53的第382赖氨酸位点(p53K382me1) 并抑制p53的活性[20]。SET8通过上述途径来调控相 关基因的表达。 3 SET8在肿瘤发生中的作用

Takawa等[21]研究发现SET8在膀胱癌、非小 细胞肺癌、小细胞肺癌、慢性骨髓源性白血病、 肝细胞癌、前列腺癌等多种肿瘤组织中均表达上 调,影响着肿瘤的发生、发展。SET8参与调节细 胞周期、染色质稳定性以及基因的转录,在基因 水平和蛋白水平调控多种肿瘤相关因子表达,基 于其对组蛋白、非组蛋白的修饰作用,SET8可 能直接或间接影响肿瘤的发生及进展。近年来对 SET8基因miR-502结合区单核苷酸多态性和肿瘤关 系的研究进一步证实SET8在肿瘤发生发展中发挥 重要作用。 3.1 SET8与乳腺癌

对1 110例乳腺癌患者发病年龄分析发现, SET8启动子区域的miR-502结合位点rs16917496 的单核苷酸多态性与绝经前妇女乳腺癌发病年龄 相关,携带rs16917496 CC等位基因的乳腺癌患者 发病年龄提前。且与TP53 GG基因型存在协同作 用。同时研究发现SET8 CC基因型绝经前妇女乳 腺癌发病风险高于SET8TT基因型,且与C等位基 因数量相关[22]。SET8能够特异性单甲基化p53第 382赖氨酸位点,抑制p53介导的靶基因活化,致 使p53通路失活,最终导致肿瘤的发生、发展。 通过基因敲除技术进一步证实了SET8对p53具有 负性调控作用[20]。研究发现在乳腺癌细胞中缺乏 Numb表达,Notch活性增强。在哺乳动物中Numb 以多种亚型存在,通过与p53结合维持p53稳定性 发挥肿瘤抑制作用[23],而SET8能够甲基化Numb第 158和163位赖氨酸残基,使Numb与p53分离,导致 p53泛素化降解。敲除癌细胞中SET8能增强Numb 与p53相互作用促进凋亡或用多柔比星处理细胞 能降低SET8 mRNA及蛋白水平,诱导凋亡[24]。此 外,SET8还与乳腺癌的转移有关。Twist作为上皮 间质转化(EMT)过程中的关键调控因子,对肿 瘤的侵袭和转移有重要影响。SET8可作为表观修 饰因子作用于Twist靶向基因E-钙黏蛋白和N-钙黏 蛋白的基因启动子上,使启动子发生H4K20单甲基 化。SET8和Twist可共同促进EMT间质标志基因 N-cadherin的转录,同时又共同转录抑制上皮标志 基因E-cadherin的表达,促进了乳腺癌细胞的EMT 及其转移[19]。SET8在乳腺癌的发生、发展中起 着重要作用,其可能是通过调控p53、Numb以及 Twist等相关基因来实现的。 3.2 SET8与肝癌

对142例肝癌患者SET8基因型和其蛋白表达 情况与肝癌患者术后3年生存率的关系进行分析发 现[25],SET8基因3’端非翻译区种子区域miR-502 结合部位多态位点rs16917496 CC基因型患者术 后3年生存率明显高于CT、TT基因型,并可作为 肝癌患者预后的独立预测因素,该研究提示SET8 rs16917496位点的多态性有望成为预测肝癌患者 生存预后的标志物,这也为以后研究SET8在肿 瘤发生、发展中的作用及其在治疗中的作用提供 了可参考的方向。Guo等[25]在分析了SET8基因3’ 端非翻译区种子区域miR-502结合部位多态位点 rs16917496的多态性与肝癌患者发病风险和生存 预后的关系基础上,又进一步对上述142例的肝癌 标本进行了SET8的免疫组织化学染色,发现携带 SET8 CC基因型患者SET8表达水平明显低于携带 SET8 CT、TT基因型患者的,且前者的生存时间 明显延长,这一方面说明miR-502对SET8基因的 表达具有调控作用,另一方面也说明了SET8在肝 癌的发生、发展可能起着重要作用。但miR-502 是如何调控SET8基因表达的,以及SET8在肝癌 发生、发展中的具体作用机制目前研究甚少。目 前研究的相关机制显示,作为小分子非编码RNA 的microRNA可与靶基因mRNA 3’端非翻译区碱基 配对结合调控基因表达,降解mRNA或抑制蛋白 翻译[26]。SET8 CC基因型与miR-502结合亲密性更 好,从而调节SET8蛋白表达,以一种隐性方式影 响肝癌预后。其作用机制可能是通过TP53通路来 实现的。但有关miR-502对SET8基因表达的具体 调控机制有待于进一步深入研究。 3.3 SET8与非小细胞肺癌

对164例非小细胞肺癌(non-small cell lung cancer,NSCLC)患者SET8 3’非编码区rs16917496 位点单核苷酸多态性分析的结果显示[2 7]: 与 rs16917496 CC基因型相比,携带rs16917496 TT 基因型NSCLC发病风险高且与TP53 GG基因型存 在协同作用。在此之前,Xu等[28]对576例NSCLC 患者进行生存分析发现,携带rs16917496 CC基因 型的NSCLC患者生存时间较长,死亡风险低。进 一步证实SET8参与了肿瘤的发生发展。此外,Xu 等[28]还通过瞬时转染技术在体外细胞实验中发现 携带C等位基因的报告基因表达水平低于携带T等 位基因的报告基因,在细胞水平证实miR-502是 通过与SET8 rs16917496不同基因型结合亲密性不 同,调控SET8表达。对肺癌组织标本免疫组织化 学染色进一步证实了rs16917496 CC基因型SET8蛋 白表达水平明显低于CT、TT基因型的SET8蛋白表 达,并且与NSCLC患者生存时间相关。但SET8在 肿瘤发生发展中的作用机制目前尚不明确。之前 也有研究报道SET8基因miR-502结合区域单核苷酸 多态性影响小细胞肺癌预后[29]并与卵巢癌发病风 险有关[30]。综合上面有关SET8在多种肿瘤中的研 究提示,SET8 rs16917496位点单核苷酸多态性有 可能成为独立判断肿瘤发病风险和预后的理想指 标之一,但SET8在肿瘤发生、发展中的具体作用 机制仍需进一步研究。 4 展望

除了在有关SET8晶体学结构、作用机制和 生理功能的研究取得了较大的进展,其在临床方 面的研究也有了长足的进步,目前对SET8基因 miR-502结合区单核苷酸多态性和肿瘤关系的研 究开始出现。但还存在许多关键问题有待进一步 解决,如SET8在肿瘤的发生和转移中的作用机制 仍需进一步探讨和研究。SET8在肿瘤的预测、早 期诊断、病情发展与预后方面具有很大的潜在价 值,随着研究的深入,对SET8的认识会更加全 面,SET8有望成为下一个肿瘤治疗的靶向蛋白, 为肿瘤治疗提供新的方向。

参考文献
[1] Xiao B, Jing C, Kelly G, et al. Specificity and mechanism of the histone methyltransferase Pr-Set7[J]. Genes Dev, 2005, 19(12): 1444-54.
[2] Couture JF, Collazo E, Brunzelle JS, et al. Structural and functional analysis of SET8, a histone H4 Lys-20 methyltransferase[J]. Genes Dev, 2005, 19(12): 1455-65.
[3] Fang J, Feng Q, Ketel CS, et al. Purification and functional characterization of SET8, a nucleosomal histone H4-lysine 20-specific methyltransferase[J]. Curr Biol, 2002, 12(13): 1086-99.
[4] Abbas T, Shibata E, Park J, et al. CRL4(Cdt2) regulates cell proliferation and histone gene expression by targeting PR-Set7/ Set8 for degradation[J]. Mol Cell, 2010, 40(1): 9-21.
[5] Liang XQ, Du YP, Wang DL, et al. The biological functions of lysine methyltransferase PR-SET7[J]. Yi Chuan, 2013, 35(3): 241-54.
[6] Wu S, Wang W, Kong X, et al. Dynamic regulation of the PRSet7 histone methyltransferase is required for normal cell cycle progression[J]. Genes Dev, 2010, 24(22): 2531-42.
[7] Oda H, Okamoto I, Murphy N, et al. Monomethylation of histone H4-lysine 20 is involved in chromosome structure and stability and is essential for mouse development[J]. Mol Cell Biol, 2009, 29(8): 2278-95.
[8] Houston SI, McManus KJ, Adams MM, et al. Catalytic function of the PR-Set7 histone H4 lysine 20 monomethyltransferase is essential for mitotic entry and genomic stability[J]. J Biol Chem, 2008, 283(28): 19478-88.
[9] Wu S, Rice JC. A new regulator of the cell cycle: the PR-Set7 histone methyltransferase[J]. Cell Cycle, 2011, 10(1): 68-72.
[10] Le e J , Zh o u P. SETt i n g t h e c l o c k f o r h i s t o n e H4 monomethylation[J]. Mol Cell, 2010, 40(3): 345-6.
[11] Yin Y,Yu VC, Zhu G, et al. SET8 plays a role in controlling G1/S transition by blocking lysine acetylation in histone through binding to H4 N-terminal tail[J]. Cell Cycle, 2008, 7(10): 1423-32.
[12] Sakaguchi A, Steward R. Aberrant monomethylation of histone H4 lysine 20 activates the DNA damage checkpoint in Drosophila melanogaster[J]. J Cell Biol, 2007, 176(2): 155-62.
[13] Davey CA, Sargent DF, Luger K, et al. Solvent mediated interactions in the structure of the nucleosome core particle at 1.9 a resolution[J]. J Mol Biol, 2002, 319(5): 1097-113.
[14] Dorigo B, Schalch T, Bystricky K, et al. Chromatin ?ber folding: requirement for the histone H4 N-terminal tail[J]. J Mol Biol, 2003, 327(1): 85-96.
[15] Trojer P, Li G, Sims RJ 3rd, et al. L3MBTL1, a histonemethylation- dependent chromatin lock[J]. Cell, 2007, 129(5): 915-28.
[16] Scharf AN, Meier K, Seitz V, et al. Monomethylation of lysine 20 on histone H4 facilitates chromatin maturation[J]. Mol Cell Biol, 2009, 29(1): 57-67.
[17] Lu X, Simon MD, Chodaparambil JV, et al. The effect of H3K79 dimethylation and H4K20 trimethylation on nucleosome and chromatin structure[J]. Nat Struct Mol Biol, 2008, 15(10): 1122-4.
[18] Li Z, Nie F, Wang S, et al. Histone H4 Lys 20 monomethylation by histone methylase SET8 mediates Wnt target gene activation[J]. Proc Natl Acad Sci U S A, 2011, 108(8): 3116-23.
[19] Yang F, Sun L, Li Q, et al. SET8 promotes epithelial-mesenchymal transition and confers TWIST dual transcriptional activities[J]. EMBO J, 2012, 31(1): 110-23.
[20] Shi X, Kachirskaia I, Yamaguchi H, et al. Modulation of p53 function by SET8-mediated methylation at lysine 382[J]. Mol Cell, 2007, 27(4): 636-46.
[21] Takawa M, Cho HS, Hayami S, et al. Histone lysine methyltransferase SETD8 promotes carcinogenesis by deregulating PCNA expression[J]. Cancer Res, 2012, 72(13): 3217-27.
[22] Song F, Zheng H, Liu B, et al. An miR-502-binding site singlenucleotide polymorphism in the 3’-untranslated region of the SET8 gene is associated with early age of breast cancer onset[J]. Clin Cancer Res, 2009, 15(19): 6292-300.
[23] Colaluca IN, Tosoni D, Nuciforo P, et al. NUMB controls p53 tumour suppressor activity[J]. Nature, 2008, 451(7174): 76-80.
[24] Dhami GK, Liu H, Galka M, et al. Dynamic methylation of Numb by Set8 regulates its binding to p53 and apoptosis[J]. Mol Cell, 2013, 50(4): 565-76.
[25] Guo Z, Wu C, Wang X, et al. A polymorphism at the miR-502 binding site in the 3’-untranslated region of the histone methyltransferase SET8 is associated with hepatocellular carcinoma outcome[J]. Int J Cancer, 2012, 131(6): 1318-22.
[26] Fabbri M, Croce CM, Calin GA. MicroRNAs[J]. Cancer J, 2008, 14(1): 1-6.
[27] Yang S, Guo H, Wei B, et al. Association of miR-502-binding site single nucleotide polymorphism in the 3’-untranslated region of SET8 and TP53 codon 72 polymorphism with non-small cell lung cancer in Chinese population[J]. Acta Biochim Biophys Sin(Shanghai), 2014, 46(2): 149-54.
[28] Xu J, Yin Z, Gao W, et al. Genetic variation in a microRNA-502 minding site in SET8 gene confers clinical outcome of non-small cell lung cancer in a Chinese population[J]. PLoS One, 2013, 8(10): e77024.
[29] Ding C, Li R, Peng J, et al. A polymorphism at the miR-502 binding site in the 3’ untranslated region of the SET8 gene is associated with the outcome of small-cell lung cancer[J]. Exp Ther Med, 2012, 3(4): 689-92.
[30] Wang C, Guo Z, Wu C, et al. A polymorphism at the miR-502 binding site in the 3’ untranslated region of the SET8 gene is associated with the risk of epithelial ovarian cancer[J]. Cancer Genet, 2012, 205(7-8): 373-6.